西红柿不同部位黑杆的原因有所出入。
如果是西红柿的茎基部黑杆，可能是茎基腐病或疫霉根腐病所致。
如果是西红柿的茎秆中上部或分杈处黑杆，可能是晚疫病、茎枯病、细菌性髓部坏死病等病害所致。
一、西红柿黑杆的原因
1、茎基部出现黑秆：植株患有茎基腐病或疫霉根腐病。
2、茎秆中上部或分杈处出现黑秆：植株患有晚疫病、茎枯病、细菌性髓部坏死病等病害。
二、西红柿为什么会烂杆
1、土壤湿度大因为冬季大棚内温度低，湿度相对较大，植株叶片的蒸腾量小，大量浇水造成地温过低，土壤通透性差，从而引起烂根、沤根的现象。
2、夜温低根系生长的适宜温度为20-30℃，低于13℃生理机能下降。长期13℃植株生长不良，6-8℃停止生长。大棚内夜间气温应保持在15℃以上才可以确保地温在20℃以上。
3、昼夜温差大番茄结果期的适宜温度，白天为25-28℃，夜间为16-20℃。当长时间夜间温度低于15℃，且日温高于30℃时，地下部根系受损，地上部蒸腾过大，从而引起植株萎蔫。
4、重茬时间长长期重茬土壤内会残留大量的各种致病菌，病菌的活动使番茄易感青枯病、枯萎病、等病害。而且容易影响土壤的团粒结构，损害土壤通透性。
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